L'ISMETT è in grado di offrire le procedure endoscopiche sull'apparato gastroenterico diagnostiche e terapeutiche più all'avanguardia. Queste vengono routinariamente eseguite con l'ausilio di un anestesista o infermiere di anestesia dedicato alla sedazione del paziente durante lo svolgimento dell'esame e nella fase del risveglio.