In ISMETT l’attività clinica è organizzata per Dipartimenti.

Sono 5 quelli attivi a cui afferiscono le relative Unità Operative:

• Dipartimento di Anestesia e terapia intensiva.  Direttore Antonio Arcadipane
• Dipartimento per la Cura e lo studio delle patologie addominali e dei trapianti addominali. Direttore Salvatore Gruttadauria
• Dipartimento di Pediatria per la cura e lo studio delle patologie addominali e dei trapianti addominali. Direttore Jean de Ville de Goyet
• Dipartimento per la Cura e lo studio delle patologie cardiotoraciche e dei trapianti cardiotoracici. Direttore Michele Pilato
• Dipartimento Servizi diagnostici e terapeutici. Direttore Angelo Luca